在制取二级大豆油的时候，油脂设备仅靠淡水来完成毛油的水化脱胶是无法达到油脂质量要求的，这主要是因为毛油中的非水化磷脂没有被完全去除导致的，当遇到这种情况的时候，可以通过以下两种方法来脱去大豆毛油中的非水化磷脂。

1.加磷酸脱胶

先将经过过滤或者是沉淀之后的大豆毛油放入水化锅中，将水化锅中毛油的温度控制在60-70℃之间充分的搅拌10分钟左右。接着加入浓度为85%，重量为毛油0.05%-0.1%的食用级磷酸，以每分钟大约为60-70r的速度搅拌20-30分钟之后加水进行水化。此时加入水的温度应该略高于油温，加水的量大约占毛油重量的3%-5%，之后以相同的搅拌速度搅拌15-20分钟左右。当有胶粒大团析出絮凝的时候，将搅拌速度减小到每分钟30-40r，搅拌15-20分钟之后进行静置沉淀，沉淀时间大约需要6-8小时。完成沉淀之后将油脚进行分离，再经过真空脱溶之后方可制成二级大豆油。

2.淡碱水脱胶

与加磷酸脱胶的前处理相同，都是将毛油放入水化锅中搅拌5-10分钟，然后直接加入淡碱水进行水化。该操作中，加入淡碱水的量为毛油重量的3-5%，浓度为3.65%-8.07%，水的温度要略高于油温或者与油温相同，需要注意的是全部的碱液要在5-10分钟之内加完。接着在速度为每分钟60-70r的条件下搅拌20-630分钟，油温要保持不变。当水化锅中有明显的分离现象时，降低速度到每分钟30-40r再继续搅拌15-20分钟，最后静置沉淀，油脚分离（与加磷酸脱胶时的相同）。